一、中介服务费

如果公司情况比较复杂，又不是新公司，那么过户的时候最好聘请律师事务所和会计师事务所来配合。聘请律师可以为企业提供法律服务，转让过程中应遵循的法律法规需要律师提醒，可以方便企业正确经营，少走弯路。聘请会计主要起评估作用，可以对企业资产进行审计，结合企业资产价格和市三级资质价格确定转让费。

所以如果和第三方机构合作，代理费是不可避免的。这是不必要的。对于小公司来说，如果股权结构单一，资产状况清晰，就不需要聘请中介，直接进行变更。

第二，雕刻的成本

市级三级资质变更后，必须变更法人。这时候就需要重新刻制印章，要在变更营业执照后进行。如果企业名称没有变更，只需要重新刻制企业印章即可。对于雕刻公司来说，雕刻是要成本的，所以雕刻费是不可避免的。

第三，纳税申报费

在上海，三级市级资质变更，资质变更前必须变更营业执照。在变更营业执照前，应先在税务局纳税，并取得相关完税证明。涉及的税种有印花税、企业所得税、个人所得税，其中印花税是必须要交的，后两者视情况而定。关于税费，税率是固定的，主要看应纳税所得额。

因此，上海市市级三级资质变更涉及的手续费主要是税费、代理费和刻章费。这里的手续费不是指双方交易的资质变更费。市级三级资质变更过程中变更营业执照、市级资质证书、安全生产许可证不收费，主管机关均为国家行政机关。