在企业代理记账制度的制定和执行过程中，人既是制定制度和实施制度的主体，又是制度管理的对象。要实现企业代理记账规范的目标，很大程度上取决于会计人员素质的高低。因此?要突出以人为本，注重对人的政治思想教育，及时掌握他们的思想动态和行为状况，消除可能潜在的违规动机，防患于未然。同时要定期进行业务培训和继续教育，不断更新会计人员的业务知识，提高他们的业务水平和工作能力。
总之，代理记账作为新生事物，其存在和发展是历史的必然，随着多种经济形式的进一步发展，代理记账必然会迎来新的时代，只要代理记账公司有清醒的认识，扬长避短、不断开拓，其辉煌是指日可待的。
虽然代理记账行业如此的火爆，但大多数业内人士认为代理记账行业在很多方面存在一定的问题。某代理记账公司负责人夏先生认为，现在关于代理记账行业监管的法规只有财政部于1994年7月1日起开始实施的《代理记账管理暂行办法》，距今已有12年了。在这期间，代理记账行业的监管均依照此法。但此暂行办法对代理记账行业监管的某些规定并不明晰，对代理记账行业本身并没有太多的约束，另外作为此行业的监管部门，并没有特别有效的手段对行业进行监管，以至于在行业竞争的某些方面不尽如人意，导致行业内部出现了许多问题。
首先，代理记账行业的门槛太低，导致了现在行业管理的混乱。代理记账行业的门槛太低吸引了大量新公司的加入，而在这些新加入的公司中，必然存在着有些公司资质较差、甚至是没有任何手续的情况。根据《代理记账管理暂行办法》的第三条中规定，代理记账公司的人员配备中至少有三名持有会计证的专职从业人员，同时可以聘用一定数量相同条件的兼职从业人员，另外主管代理记账业务的负责人必须具有会计师以上专业技术资格。但据大多数正在委托或曾经委托代理记账的企业介绍，在代理记账行业内，一些新成立的公司在取得从事行业资格的过程中存在着欺骗的现象，在他们所接触到的许多代理记账公司中，类似于小作坊的公司很多。有的公司无论从资金实力、人员配备还是专业水平上，都不很规范。正是这种情况导致他们中有的对代理记账行业产生较大的怀疑，有的干脆不再委托代理记账。
其次，由于现在代理记账公司数量很多，资质又良莠不齐，因此在市场竞争中有些公司不免要以降低价格来吸引客户，引起恶性竞争。价格的偏低这将势必影响其服务的质量。据某公司主任会计师姜女士介绍，代理记账公司在给客户提供服务时，为了保证服务的质量，一般都需要3个人来完成工作，这3个人将组成一个工作组，每个人都有各自不同的分工，以保证客户的满意。但这样做的成本是相当高的，她说，现在每个组每月最多可以作30套账，依照每套300元的市场价格，月收入也就近万元，如果除去包括办公等各项费用与公司其他人员开支，其实所剩无几。因此，一些代理记账公司为了降低经营成本，适当减少办公人员或简化办公环节，因此服务质量每况愈下就是必然的。另一方面由于代理记账行业收入并不高，因此导致人员流动过于频繁，很多人在干了一段时间后就主动离开。特别是从专业学院毕业的毕业生，他们毕业后往往没有实践经验，因此想要找到合适的财务工作可能较难，而一旦在代理记账公司工作一段时间后，经过培训和学习，有了长足的进步，则会嫌收入少而离开公司，转投他家。对此，很多公司的负责人都表示无奈。
代理记账行业还有一个突出的问题是，我们国内法制体系不健全，外部代理风险比较大。比如，代理记账本身很简单，但是一旦涉税就很复杂，税务与会计的处理存在不同，税务机关有较大的自由度，就关系到代理记账高层与税务机关的关系
